• 變化一：知識產(chǎn)權(quán)方面，取消獨占許可類型知識產(chǎn)權(quán)。與自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等取得知識產(chǎn)權(quán)相比，“獨占許可”取得知識產(chǎn)權(quán)是通過簽署“獨占許可協(xié)議”的方式獲取，涉及境外知識產(chǎn)權(quán)在中國境內(nèi)的獨占許可協(xié)議，目前國家知識產(chǎn)權(quán)局尚不予受理備案登記，具有一定的隱藏性，主管機關(guān)監(jiān)管困難，在部分執(zhí)行寬松的地區(qū)被部分企業(yè)濫用，部分地區(qū)在高新復(fù)審中已明確將不信任“獨占許可”取得知識產(chǎn)權(quán)，在此背景下，新規(guī)予以取消。

• 變化二：人員比例方面，放寬對科技人員和研發(fā)人員比例的要求。新辦法由現(xiàn)行“科技人員占企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)的30%以上”調(diào)整為“科技人員占企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)的比例不低于10%”，同時取消“大學(xué)?？埔陨蠈W(xué)歷”的限制；取消“研發(fā)人員占企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)的10%以上”的規(guī)定。

• 變化三：研發(fā)費用方面，降低研發(fā)費用比例要求。研發(fā)費用比例在高新認定中是幾個*為核心的指標(biāo)，新辦法將“三檔”降為“兩檔”，以2億元作為分水嶺，設(shè)置4%和3%兩個比例。將2億元以下統(tǒng)一設(shè)置為4%，取消6%的比例規(guī)定，意在鼓勵中小企業(yè)科技創(chuàng)新和發(fā)展，使得包括“新三板”在內(nèi)的中小企業(yè)可以申請高新資格。

• 變化四：申請資料方面，增加企業(yè)所得稅年度納稅申請表。新辦法規(guī)定，申請高新資格提交的材料中應(yīng)包含“近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申請表”，同時，對企業(yè)稅務(wù)的規(guī)范性提出了更高的要求，企業(yè)理念的納稅申報記錄與會計報表等提交其他資料應(yīng)保持內(nèi)在邏輯的一致性。2014版申報表由原來的17張增加到41張，信息更為豐富完整，為稅務(wù)機關(guān)開展所得稅后續(xù)管理和風(fēng)險管理、納稅評估提供了基礎(chǔ)信息。

• 變化五：年度備案方面，增加填報“年度發(fā)展情況表”要求。現(xiàn)行辦法并沒有明確要求高新企業(yè)年度進行備案，而在國稅函{2009}203號文第五條就產(chǎn)品（服務(wù)）范圍、研究開發(fā)費用、高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入比重、科技人員比例，要求企業(yè)應(yīng)向主管稅務(wù)機關(guān)備案。新辦法將高新企業(yè)年度備案列為法定義務(wù)，在具體備案的內(nèi)容上基本與203號文保持一一致，特別需要強調(diào)的是，按照新辦法第十九條的規(guī)定，了幾兩年未填報年度發(fā)展情況表的，將被取消高新技術(shù)企業(yè)資格，同時依據(jù)本條的規(guī)定，被取消高新技術(shù)企業(yè)資格的企業(yè)，要追繳其發(fā)生上述行為所屬年度起已享受的高新技術(shù)企業(yè)稅收優(yōu)惠。

• 變化六：名稱等信息變更方面，未進行報告將被取消高新資格。現(xiàn)行辦法下，針對名稱變更，專門出臺了《關(guān)于高新技術(shù)企業(yè)更名和復(fù)審等有關(guān)事項的通知》及附件《高新技術(shù)企業(yè)更名管理工作規(guī)程（試行）》，以規(guī)范明確有關(guān)高新更名處理事項，在新的規(guī)定出臺之前，企業(yè)可以參考123號文的要求，及時向主管部門報告。否則按照新辦法的規(guī)定，將被取消高新技術(shù)企業(yè)資格，并要追繳其發(fā)生上述行為所屬年度起已銷售的高新技術(shù)企業(yè)稅收優(yōu)惠。

• 變化七：取消高新資格法定情形方面，企業(yè)重大、嚴(yán)重違規(guī)行為取消高新資格并補稅。實務(wù)中，由于高新企業(yè)的一個性質(zhì)輕微的違規(guī)行為，面臨被取消高新資格的局面，因此，新規(guī)定更加符合管理中千差萬別的實際，也更加公平公正合理，需要提醒的是，主管機關(guān)在認定中將會有很大的自由裁量權(quán)，國家需要進一步明確規(guī)定，防范這一權(quán)力被濫用。現(xiàn)行辦法規(guī)定，法定情形下取消的高新技術(shù)企業(yè)為了5年不得申請高新資格，新辦法予以取消，并規(guī)定要按照征管法等規(guī)定予以處理，這一改變提現(xiàn)了三部門“落實稅收法定原則，是稅收法治的1次具體提現(xiàn)。

• 變化八：公示時間方面，由之前的15個工作日縮短為10個工作日。

高新認定條件上分為七個方面的內(nèi)容，包括：

1. 年限；

2. 知識產(chǎn)權(quán)；

3. 主要產(chǎn)品（服務(wù)）；

4. 高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入占比；

5. 企業(yè)科技人員占比；

6. 企業(yè)研究開發(fā)費用占比；

7. 企業(yè)創(chuàng)新能力評價。

• 新的《工作指引》采用分類評價方式更加提現(xiàn)了對不同知識產(chǎn)權(quán)的信任、保護程度不同，相對于不同類型的知識產(chǎn)權(quán)更加公平公正。對于按II類評價的知識產(chǎn)權(quán)在申請高新技術(shù)企業(yè)時，僅限使用1次。由于I類知識產(chǎn)權(quán)創(chuàng)造性要求更高、認定程序更為嚴(yán)格、審批周期更長，轉(zhuǎn)化后的價值更高，對于I類和II類分別評價更加體現(xiàn)公平性，更有利于鼓勵企業(yè)的自主創(chuàng)新。

• 根據(jù)《工作指引》的要求，如果II類專利，若集團公司或下屬的任一子公司使用過，則該項專利在申請高新時將不能再使用。此外，在知識產(chǎn)權(quán)的有效性上不在局限于以取得證書為準(zhǔn)，增加了企業(yè)取得授權(quán)書并能提供繳費收據(jù)為準(zhǔn)的方式，解決實際工作中I類知識產(chǎn)權(quán)申請時間長的難題。

《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》第十一條第（二）款規(guī)定企業(yè)通過自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產(chǎn)品（服務(wù)）在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用的知識產(chǎn)權(quán)的所有權(quán)；（三）對企業(yè)主要產(chǎn)品（服務(wù)）發(fā)揮核心支持作用的技術(shù)屬于《國家重點支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》規(guī)定的范圍。

• 一直以來，申報過程中對“總收入“都沒有明確的界定，稅務(wù)局、科委各執(zhí)一詞，以北京市為例，實踐中各區(qū)將總收入與銷售收入劃等。

• 指引明確：總收入是指收入總額減去不征稅收入。

企業(yè)職工總數(shù)、科技人員數(shù)均按照全年月平均數(shù)計算。以往申報均是以企業(yè)上一年末的在職員工來統(tǒng)計，按照月平均的統(tǒng)計方法真是反應(yīng)企業(yè)職工及科研人員投入研發(fā)的狀況，但是如果按該統(tǒng)計方法提交材料，則會出現(xiàn)一定困難，特別是中小企業(yè)人員流動性大，月均數(shù)可能大于職工總數(shù)，職工花名冊及科技人員名單如按月均數(shù)提供，就需要將已經(jīng)離職的職工也統(tǒng)計進來，增加統(tǒng)計負擔(dān)。

《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》第十一條第五款規(guī)定，企業(yè)近三個會計年度的研究開發(fā)費用總額占同期銷售收入總額的比例應(yīng)符合要求。新的《工作指引》明確銷售收入為主營業(yè)務(wù)收入與其他業(yè)務(wù)收入之和，主營業(yè)務(wù)收入與其他業(yè)務(wù)收入按照企業(yè)所得稅年度納稅申報表口徑計算。同時規(guī)定企業(yè)應(yīng)按照“企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表“設(shè)置高新技術(shù)企業(yè)認定專用研究開發(fā)費用輔助核算賬目，提供相關(guān)憑證及明細表。

與2008版《工作指引》相比，企業(yè)創(chuàng)新能力評價調(diào)整較多，對知識產(chǎn)權(quán)評判的標(biāo)準(zhǔn)不再局限于過去量化的指標(biāo)，增加了對知識產(chǎn)權(quán)技術(shù)先進成都以及其對主要產(chǎn)品（服務(wù)）在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用等定性指標(biāo)的考核，并根據(jù)知識產(chǎn)權(quán)的類別及獲得方式等分別傅粉。

新的《工作指引》對成長性指標(biāo)的考核將總資產(chǎn)增長率調(diào)整為凈資產(chǎn)增長率，凈資產(chǎn)增長率是指企業(yè)本期凈資產(chǎn)增加額與上期凈資產(chǎn)總額的比率?？傎Y產(chǎn)=凈資產(chǎn)+負債，相對于總資產(chǎn)增長率，凈資產(chǎn)增長率更能反映企業(yè)資本規(guī)模的擴張速度和成長狀況，對于第1檔分數(shù)規(guī)定35%對于大企業(yè)的影響更為突出。