一、研發(fā)人員的統(tǒng)計
1、難點
研發(fā)人員，是指從事研究開發(fā)項目的專業(yè)人員。主要包括研究人員、技術(shù)人員和輔助人員。  
對人員人工的審核，關(guān)鍵是對研發(fā)人員的范圍認定和費用金額的歸集。如果參與研究開發(fā)的人員不是專職從事研究開發(fā)項目或同時參與多個研究開發(fā)項目，其薪酬如何分攤?cè)胙芯块_發(fā)項目、如何在不同研究開發(fā)項目間分攤就成為審核的重點和難點。主要表現(xiàn)在一下幾方面：
①部分申報企業(yè)特別是中小型企業(yè)的管理層，在對整個企業(yè)的生產(chǎn)、經(jīng)營進行管理的同時，往往也參與研究開發(fā)工作，如何將其薪酬計入研究開發(fā)活動沒有明確規(guī)定。
②有些研究開發(fā)項目的研究開發(fā)活動涉及多個部門，甚至多個企業(yè)，在這種情況下人員人工的歸集和分配也比較困難。
③有不少申報企業(yè)為了達到增加研究開發(fā)費用總額的目的，將研究開發(fā)項目立項書中未列示的管理人員（包括業(yè)主）、生產(chǎn)人員的薪酬計入研究開發(fā)人員人工。
2、應對措施
（1）重點檢查應付工資、管理費用明細賬，全年各月份工資表，全年個人所得稅申報表，勞動合同、教育背景（必要時通過檢查學歷證明，以確定研發(fā)人員是否具備相關(guān)專業(yè)背景）、工作經(jīng)驗和參加社會保險等資料，結(jié)合研究開發(fā)部門人員名單，確定研發(fā)人員的工資費用是否真實，計算是否正確。  
（2）對受雇的研發(fā)人員，需取得累計實際工作時間在183天以上的證據(jù)。
（3）對企業(yè)存在多個研究開發(fā)項目的，按實際參與的項目進行歸集。若研發(fā)人員同時參與兩個或兩個以上項目，應按統(tǒng)計的工作量進行分攤。如申報企業(yè)因不能正確地對工作量進行統(tǒng)計而常采用其他方法進行分攤，應檢查其分攤的合理性。

二、研發(fā)費用直接投入核算
1、難點
《工作指引》中較明確規(guī)定了直接投入的開支范圍，但企業(yè)實際發(fā)生的研發(fā)費中的材料費品種繁多，部分領(lǐng)料單上亦未寫明具體用于什么研究開發(fā)項目，直接投入的認定和分配缺乏可行的依據(jù)。
此外，很多申報企業(yè)特別是中小型企業(yè)以前年度并沒有獨立設(shè)置研發(fā)費用科目，發(fā)生的研發(fā)費分別記載于不同的會計科目，如實驗車間成本、管理費用、其他業(yè)務支出、在建工程、專項應付款等，而不同會計科目之間又不存在對申報明細表而言的勾稽關(guān)系。因此，申報企業(yè)將非研發(fā)材料成本計入研發(fā)直接投入中的人為操作空間很大。  
2、應對措施
（1）對于日常生產(chǎn)領(lǐng)用材料和研究開發(fā)領(lǐng)用材料的區(qū)分，除通過重點檢查管理費用、原材料明細賬、原材料購入、發(fā)出、結(jié)存明細表、相關(guān)費用分配表等外，審計人員還可以考慮進行如下分析判斷：  
①總量領(lǐng)用的合理性判斷；  
②研究開發(fā)材料領(lǐng)用的月均波動情況是否合理；  
③領(lǐng)用材料與研究開發(fā)項目的相關(guān)性判斷，必要時可以考慮利用外部專家工作。如，聘請行業(yè)專家，對研究開發(fā)項目有關(guān)直接投入的品種、數(shù)量、質(zhì)量等因素的合理性、相關(guān)性進行評價；
④重點對研究開發(fā)材料所形成的實物成果進行盤點及殘次品的銷售進行綜合判斷。如，電纜生產(chǎn)企業(yè)研究開發(fā)項目領(lǐng)用的銅等重要材料，在考慮殘次品銷售的前提下，需要對期末實物庫存的合理性進行判斷。
（2）對于直接購入的能源、材料等，需要通過檢查購入發(fā)票、運輸單據(jù)、入庫單、領(lǐng)料單等確認其真實性，并聘請相關(guān)行業(yè)專家，確定購入的能源、材料等與研究開發(fā)項目的相關(guān)性。  
（3）對動力費用、共同使用的模具、樣品、樣機及一般測試手段購置費等，可以采用工作量等合理的方法，分攤計入各研究開發(fā)項目成本。  

三、固定資產(chǎn)折舊與長期待攤費用
1、難點
固定資產(chǎn)折舊與長期待攤費用攤銷，是指為開展研究開發(fā)活動購置的儀器和設(shè)備以及研究開發(fā)項目在用建筑物的折舊費用，包括研究開發(fā)設(shè)施改建、改裝、裝修和修理過程中發(fā)生的長期待攤費用。
2、應對措施
（1）重點檢查固定資產(chǎn)明細賬、長期待攤費用明細賬；檢查申報企業(yè)年度新增固定資產(chǎn)及長期待攤費用的發(fā)票、固定資產(chǎn)的申購單、入庫單、驗收單；實地查看該部分設(shè)備，核對資產(chǎn)用途（檢查使用說明書等），確定其是否真實存在，是否用于研究開發(fā)項目。  
（2）結(jié)合固定資產(chǎn)盤點，核對與研究開發(fā)活動相關(guān)的固定資產(chǎn)是否賬實相符；檢查購入時已計入研究開發(fā)費用的固定資產(chǎn)，是否單獨管理，是否存在重復計提折舊的情況。  
（3）復核各項折舊、攤銷的正確性及相關(guān)性，關(guān)注前后各期折舊政策及方法的一致性：  
①檢查是否屬于為執(zhí)行研究開發(fā)活動而購置的儀器和設(shè)備或研究開發(fā)項目在用建筑物的折舊費用；
②檢查固定資產(chǎn)折舊計提、長期待攤費用攤銷所采用的會計政策、會計估計是否與財務報表所采用的一致，且前后各期是否保持一致，折舊或攤銷的計算是否正確；
③對于研究開發(fā)項目和非研究開發(fā)項目共用的資產(chǎn)，檢查折舊或攤銷的分配方法是否合理，且前后各期是否保持一致，分配的金額是否正確。
（4）對屬于多個項目使用的，檢查分攤方法是否合理，且前后各期是否保持一致，分攤的金額是否正確。  

四、設(shè)計費用
1、難點
設(shè)計費用，是指為新產(chǎn)品和新工藝的構(gòu)思、開發(fā)和制造，進行工序、技術(shù)規(guī)范、操作特性方面的設(shè)計等發(fā)生的費用。部分申報企業(yè)由于設(shè)立的研究開發(fā)機構(gòu)較簡單、研究開發(fā)人員力量薄弱，經(jīng)常會將一些新產(chǎn)品或新工藝的設(shè)計外包，且不少企業(yè)并未與外包單位簽訂相應的合同，或者簽訂的合同還包括了申報研究開發(fā)項目以外的其他項目的設(shè)計費用。從而較難確定設(shè)計費用的合理性，且外包性質(zhì)的設(shè)計費用容易與委托外部研究開發(fā)費用混淆。
2、應對措施
（1）重點檢查管理費用明細賬－研究開發(fā)費用明細科目，檢查設(shè)計費用支出的發(fā)票、付款申請審批單據(jù)，確認設(shè)計費用發(fā)生的合理性、真實性及正確性。  
（2）對于外包設(shè)計費，應重點檢查合同、協(xié)議、付款憑證、發(fā)票，并分析合同、協(xié)議的實質(zhì)性內(nèi)容，判斷是否屬于為新產(chǎn)品、新工藝的開發(fā)進行的技術(shù)規(guī)范和操作方面的設(shè)計而發(fā)生的費用；若合同或協(xié)議實質(zhì)表明，外包內(nèi)容系委托外部開發(fā)機構(gòu)進行實質(zhì)性改進技術(shù)、產(chǎn)品和服務活動，且與企業(yè)的主要經(jīng)營業(yè)務緊密相關(guān)，則應歸屬于委托外部研究費用，應要求被審計單位據(jù)實調(diào)整并列報。  
（3）注冊會計師應走訪被審計單位的設(shè)計、研究開發(fā)部門，或向外包單位進行函證確認，以正確區(qū)分外包設(shè)計費和外包研究開發(fā)費，必要時，應考慮利用專家工作。  

五、裝備調(diào)試費
1、難點
裝備調(diào)試費，主要包括工裝準備過程中研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用。如，研制生產(chǎn)機器、模具和工具，改變生產(chǎn)和質(zhì)量控制程序，或制定新方法及標準等。為大規(guī)模批量化和商業(yè)化生產(chǎn)所進行的常規(guī)性工裝準備和工業(yè)工程發(fā)生的費用，不能計入裝備調(diào)試費。
然而，一些用于研究開發(fā)活動的機器和模具，也可能用于生產(chǎn)。如何區(qū)分是用于大規(guī)模批量化和商業(yè)化生產(chǎn)，還是用于研究開發(fā)活動，對沒有專業(yè)背景的注冊會計師來說是審計難點。  
2、應對措施
（1）檢查是否屬于工裝準備過程中研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用。如，研制生產(chǎn)機器、模具和工具，改變生產(chǎn)和質(zhì)量控制程序，或制定新方法及標準等。
（2）檢查相關(guān)費用的核準、支付是否符合內(nèi)部管理辦法的規(guī)定，是否與原始憑證相符。  
（3）檢查是否存在列入為大規(guī)模批量化和商業(yè)化生產(chǎn)所進行的常規(guī)性工裝準備，及工業(yè)工程發(fā)生的費用的情形。  

六、無形資產(chǎn)攤銷
1、難點
無形資產(chǎn)攤銷，是指因研究開發(fā)活動需要購入的專有技術(shù)所發(fā)生的費用攤銷。包括專利、非專利發(fā)明、許可證、專有技術(shù)、設(shè)計和計算方法等。申報企業(yè)購入的無形資產(chǎn)，有時既用于生產(chǎn)經(jīng)營，又用于研究開發(fā)活動，無形資產(chǎn)是否與研發(fā)項目相關(guān)，如何分攤計入研究開發(fā)費用很難把握。  
2、應對措施
（1）檢查是否屬于因研究開發(fā)活動需要而購入的專利、非專利發(fā)明、許可證、專有技術(shù)、設(shè)計和計算方法等所發(fā)生的費用攤銷。可以通過對項目立項、專家評定等技術(shù)資料的分析，判斷其相關(guān)性；當影響重大時，需要考慮借助其他行業(yè)專家的工作。  
（2）取得無形資產(chǎn)初始購置時的協(xié)議或合同、發(fā)票、付款憑證等，檢查無形資產(chǎn)原值的確認是否正確；檢查攤銷政策是否正確，且前后各期保持一致，計算檢查攤銷的金額是否正確。  
（3）檢查是否存在列入與研究開發(fā)項目無關(guān)的其他無形資產(chǎn)攤銷的情形；若存在無形資產(chǎn)費用在研究開發(fā)項目與其他項目之間分攤的情形，需檢查分攤方法是否合理、前后各期是否保持一致，并計算檢查分攤的金額是否正確。

七、委托外部研究開發(fā)費用
1、難點
委托外部研究開發(fā)費用，是指企業(yè)委托境內(nèi)其他企業(yè)、大學、研究機構(gòu)、轉(zhuǎn)制院所、技術(shù)專業(yè)服務機構(gòu)和境外機構(gòu)進行研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用，項目成果為企業(yè)擁有，且與企業(yè)的主要經(jīng)營業(yè)務緊密相關(guān)。中小型申報企業(yè)由于設(shè)立的研究開發(fā)機構(gòu)力量薄弱，一般會與研究院、高校等科研機構(gòu)合作開展研究開發(fā)活動，與其簽訂相應的委托開發(fā)合同或合作協(xié)議。  
2、應對措施
（1）重點檢查管理費用明細賬、與委托外部研究開發(fā)費用相關(guān)的明細賬，委托外部研究開發(fā)費用的合同或協(xié)議、發(fā)票、付款憑證；針對研究開發(fā)項目工作內(nèi)容、協(xié)議條款、協(xié)議金額等向受托方進行函證，確認其發(fā)生的真實性及金額的正確性；關(guān)注并確認是否為關(guān)聯(lián)交易，如果為關(guān)聯(lián)交易，發(fā)生金額應按照獨立交易原則確定。  
（2）復算檢查委托外部研究開發(fā)費用，是否按照委托外部研究開發(fā)費用發(fā)生額的80％計入研究開發(fā)費用總額。  

八、其他費用
1、難點
其他費用與研究開發(fā)項目相關(guān)性、真實性、完整性的認定，存在較大錯報風險。
2、應對措施
（1）重點檢查管理費用明細賬、費用分攤表，確認費用支出與研究開發(fā)項目的相關(guān)性及費用分攤的合理性。  
（2）關(guān)注如辦公費、通訊費、專利申請維護費、高新科技研究開發(fā)保險費等其他費用，是否屬于為研究開發(fā)活動所發(fā)生的，是否存在列入與研究開發(fā)項目無關(guān)的其他費用的情形。  
（3）檢查相關(guān)費用的核準和支付是否符合企業(yè)內(nèi)部管理的規(guī)定，是否與原始憑證相符。  
（4）復算檢查列報的其他費用是否*過研究開發(fā)費用總額的10%。

九、復核研究開發(fā)費用總額占銷售收入總額的比例
1、難點
《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》規(guī)定，高新技術(shù)企業(yè)認定必須滿足*近三個會計年度研究開發(fā)費用總額占銷售收入總額的一定比例。因此，申報企業(yè)為了達到標準可能虛列研究開發(fā)費用，擴大研究開發(fā)費用總額。
2、應對措施
（1）獲取經(jīng)具有高新技術(shù)企業(yè)認定資質(zhì)的會計師事務所審計的，*近三個會計年度的審計報告和財務報表。  
（2）復算加計*近三個會計年度的銷售收入總額?！陡咝录夹g(shù)企業(yè)認定申請書》填報說明表明，銷售收入是指產(chǎn)品收入和技術(shù)服務收入之和；復算加計*近三個會計年度的研究開發(fā)費用總額。  
（3）復算研究開發(fā)費用總額占銷售收入總額的比例，與申報企業(yè)計算的結(jié)果核對是否一致；復算在中國境內(nèi)發(fā)生的研究開發(fā)費用總額占全部研究開發(fā)費用總額的比例，與申報企業(yè)計算的結(jié)果核對是否一致。

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